دانشگاه تبریز مهندسی مکانیک دانشگاه تبریز 2228-5148 52 4 2023 01 21 تعیین توالی DNA با استفاده از نانومنفذ عامل‌دار گرافین: مطالعه دینامیک مولکولی 249 254 15647 10.22034/jmeut.2022.50130.3052 FA محمدمهدی محمدی دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشکده مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شیراز، شیراز، ایران امید باوی استادیار، دانشکده مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شیراز، شیراز، ایران یوسف جمالی دانشیار، دانشکده علوم ریاضی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Journal Article 2022 01 29 در این تحقیق امکان تعیین توالی تک‌رشته DNA حین عبور از نانومنفذ عامل‌دار صفحات گرافینی با استفاده از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هدایت شده در سرعت ثابت بررسی شده است. جهت عامل‌دار کردن نانومنفذ، از اتم‌های هیدروژن و گروه هیدروکسیل استفاده شده است. حین عبور تک رشته DNA، نیروی مورد نیاز برای حرکت DNA به اتم فسفر ستون فقرات آن اعمال می‌شود و سپس تغییرات نیرو جهت تشخیص تمایز بین بازها بررسی شده است. همچنین، بروز تغییرات در زوایه صفحه باز نسبت به صفحه گرافین، که زاویه بتا نامیده می‌شود، حین عبور DNA از نانومنفذ بررسی شده است. نتایج نشان می‌دهد که با استفاده از این ساختار و بررسی پارامترهای مورد تحقیق، مولکول‌های سیتوزین، گوانین و تیمین با استفاده از این روش قابل تمایز هستند. این امید وجود دارد که با به خدمت گرفتن قابلیت‌های این روش و توجه بیشتر به پتانسیل‌های منحصر به فرد نانوساختارهای حالت جامد دوبعدی، افقی نو برای طراحی نسل جدید ماشین‌های توالی‌یابی پروتئین‌ها در دید محققان پروژه کلان ژنوم شناسی انسانی بگشاید. https://tumechj.tabrizu.ac.ir/article_15647_c96fc324a4c4db0d4e1aada31a384195.pdf